Du kannst im Programm oben rechts auf das Zahnrad drücken.
Dann sind unter der Registerkarte "Performance" bzw. "Leistung", unter "Playback" / Wiedergabe Optionen verfügbar, in denen du das einstellen kannst, was du haben willst.
Was du wahrscheinlich einstellen willst ist unter den "Andere Anwendung fokussiert" bzw, "Other application focused" die Option "Weiter ausführen" oder "Keep Running" und in den anderen 2 Anwendungsoptionen die Einstellung "einzeln ausführen" oder auf Englisch wieder "Pause per monitor".
Somit werden dann nur die Wallpaper in den Monitoren pausiert, auf denen ein Fenster maximiert oder eine Vollbildanwendung am laufen ist, ein Fenster auf einem Monitor beeinflusst dann hier die anderen Monitore nicht.