Wer weiss was da der Unterschied ist und was ich bei den beiden Arten der Synchronisation beachten sollte?

Google findet Vieles! http://www.uibk.ac.at/zid/systeme/mail/imappop.html
Soweit ich weis ist es beim POP3 email-Dienst so: Du gibst den Smtp Server ein und den POP3 Server in Deinem E-mailprogramm, z. B. Outlook mit Deinem Passwort. Bei diesem Dienst kannst Du e-mails holen und auch e-mails verschicken mit Deiner eigenen e-mail Adresse.