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BLAST-Algorithmus

Frage von Lea92 Lea92

Hallo!

Also wie der BLAST-Algorithmus funktioniert, habe ich nun verstanden. Nun soll ich mir überlegen, welche Anwendungsbereiche der Algorithmus z.B. anhand von Nukleotidsequenzen hat. Also, ich stieß dabei auf:

Paralogie und Orthologie.

Paralogie bezeichnet die Verwandschaft von Genen mit mgl. unterschiedlcher Funktion innerhalb eines Genoms. Könnte man nun sagen, dass man, wenn man eine Nukleotidsequenz vorliegen hat, einfach nach einer solchen Paralogie suchen kann (gibt es ja bei Hämoglobin...)?

Orthologie besagt, dass Gene in unterschiedlichen Spezies funktional verwandt sind und von einem gemeinsamen Vorläufer abstammen. Also könnte man sagen, dass Nukleotidsequenzen von Lebeweisen vergleichen könnte, um evolutionsbedingte Aussagen zu treffen?

Ich würde mich um Meinungen freuen. Beste Grüße

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Antworten (1)

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    Antwort von giordano giordano

    Ich bin kein Experte und stelle hier nur Vermutungen an. Mit orthologen Sequenzen kann man einen Speziesbaum konstruieren. Paraloge Sequenzen haben keinen gemeinsamen Ursprung, weshalb es schwieriger ist, ein Baum zu konstruieren.

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