Kann ich das markenzeichen (skoda fabia) hinten beim kofferraum abtun? oder gibt es dann irgenwelche rückstände davon löcher z.B

Dann wirst Du wohl Löcher haben und damit hat Rost ein leichtes Spiel.
Geh zu Deinem ( oder einen ) Skodahändler und frage nach der Befestigungsart, oft sind die Typenzeichen auch nur geklebt.

Da bleibt eine hässliche Delle. Kauf Dir lieber eine Kappe in Wagenfarbe oder Carbonoptik. Diese klebst Du auf das Emblem.